上海N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

Genovis的PNGase F（肽 N-糖苷酶 F）是一种糖酰胺酶，可水解多肽天冬酰胺与所有哺乳动物天冬酰胺连接复合物、杂交或高甘露糖寡糖的内层 GlcNAc 之间的酰胺键。该酶用于MS分析前的样品制备，以降低蛋白质异质性并实现游离的聚糖分析，并研究N-聚糖的功能作用。1. 对所有哺乳动物N-聚糖的高效水解；2.对多种糖蛋白具有活性；3.可固定在即用型离心柱产品形式；4. 自动化友好型，96孔板，用于高通量 N-糖去除。Genovis的ImpaRATOR 是一种 O-糖依赖性蛋白酶，可消化携带粘蛋白型。O-聚糖的蛋白质，包括唾液酸化物质、糖基化丝氨酸和 Thr 残基的 N-末端。该酶产生携带 O-糖的糖肽，从而实现 O-糖谱分析、位点占用测定和 O-糖肽图谱以及使用 LC-MS 分析的中级方法。1. 特异性广 - 接受多种 O-聚糖变体，包括唾液酸化物种；2. 可靠O-聚糖特异性蛋白酶 – 消化丝氨酸/苏氨酸糖基化位点的 N 末端；3. 稳健的消化，增强复杂生物制药的表征。OmniGLYZOR特点：与LC-MS兼容；完全去除聚糖，改进蛋白的分析；上海N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

对Genovis的ImpaRATOR处理的样品的分析表明，ImpaRATOR很好地消化了所有三种底物并产生了相似的糖肽，但预期的聚糖种类不同。用ImpaRATOR处理的样品比其他样品含有更多的变异，因为每种肽都检测到多种聚糖结构。观察到的聚糖种类主要是单唾液酸化和二唾液酸化he心1结构，这与依那西普的预期一致。用ImpaRATOR或OpeRATOR消化的SialEXO预处理样品均产生具有裸核1结构的肽，但携带在ImpaRATOR消化样品中观察到的Tn抗原的肽T205-P207除外。依那西普用 SialEXO 和 GalactEXO 预处理，然后用 ImpaRATOR 消化，得到含有 Tn 抗原的肽。总之，这些数据证明了ImpaRATOR的高聚糖底物接受度。ImpaRATOR处理的依那西普显示出与相应的去唾液酸化OpeRATOR处理样品略有不同的消化模式。例如，OpeRATOR在两个O-糖基化氨基酸之间消化的效率比ImpaRATOR更有效。具有完整唾液酸或Tn抗原的依那西普被OpeRATOR消化得非常弱（数据未显示）。黑龙江固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis人血清中 O-糖蛋白的富集：GlycOCATCH还可用于从复杂的样品混合物（如人血清）中选择性富集O-糖基化蛋白。

C1抑制剂的去糖基化：在O-糖基化生物制药的生产过程中，由于he心GalNAc残基的加工不完全，可能会出现Tn抗原。这表现为具有 203 Da HexNAc 单位差异的重复质量位移。为了确认 Tn 抗原的存在，可以应用以下工作流程，此处在重度（26 个位点）O-糖基化 C1 抑制剂上演示。首先，使用PNGaseF修剪糖蛋白的N-糖，使用Genovis的OglyZOR和SialEXO修剪he心1 O-糖。依那西普的磷性能测试 ：依那西普是另一种具有挑战性的生物制药模型分子，携带 13 个 O-聚糖位点，其中平均 9 至 10 个位点被占用。

genovis分析依那西普和曲妥珠单抗游离聚糖：为了确认依那西普和曲妥珠单抗中半乳糖损失的LC-MS数据，进行了释放的N-聚糖分析。标记的N-聚糖的分离清楚地表明了依那西普和曲妥珠单抗上半乳糖的丢失，如半乳糖基化聚糖物种的信号丢失所示。该酶是一种有价值的工具，可降低样品异质性，用于分析携带α连接的 GalNAc 残基作为未成熟截短he心 1 的复杂 O-糖蛋白。1. 高效 α-N-乙酰半乳糖胺酶 – 快速、完全去除 Tn-抗原和 α1-3-连接的 GalNAc；2. 实现完全糖基去除，以改善蛋白质表征；3. 可固定在即用型离心柱中。使用 GalactEXO 冻干和 GalactEXO 固定化都可以看到向 G0F 糖型的转变。

用于水解β1-3,4-连接半乳糖的固定化酶在离心柱中的糖蛋白上。Genovis的GalactEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的GalactEXO酶，用于糖蛋白上β1-3,4-连接半乳糖的水解，而不会用酶污染z终制剂。Microspin 色谱柱可用于水解 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白。1. 易于使用的离心柱；2. 提高酶与底物的比例，提高消化效率；3. z终样品中不含酶。GalactEXO 酶来源于 Akkermansia muciniphila 并重组表达，可有效水解 β1-3 和 β1-4 连接的半乳糖。GalactEXO微离心柱经过格式化，可在30-60分钟内水解0.5mg糖蛋白中的半乳糖。依那西普的磷性能测试 ：PNGaseF去除N-聚糖。青海瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶疾病机理研究

使用OpeRATOR进行O-糖位点定位：OpeRATOR 是一种 O-聚糖特异性蛋白酶。上海N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

GalactEXO中的酶来源于Akkermansia muciniphila，并在大肠杆菌中表达。GalactEXO由两种半乳糖苷酶组成，均带有His标签，组分的分子量为87 kDa和109 kDa。用于水解糖蛋白上β1-3,4-连接半乳糖的冻干酶。Genovis的GalactEXO 冻干剂以冻干粉的形式提供，装在 2000 单位小瓶中，用于在 2 mg 糖蛋白上水解 β1-3,4-连接的半乳糖。1. 用于方法开发的灵活格式；2. 可以结合酶以提高效率； 3. 适用于自动化工作流程；4. 即用型 - 只需加水即可！将混合物加载到GlycOCATCH上，洗涤树脂，并用8M尿素洗脱结合的肽。纯化后，在RP-LC-MS上分离样品。数据显示，糖苷酸肽的选择性纯化，携带he心1-O-聚糖。IgA 特异性 O-糖肽富集：IgA 抗体包含 N-连接的糖基化和重度 O-糖基化的铰链区域。胰蛋白酶消化IgA后，将肽和genovis 的SialEXO的混合物加载到GlycOCATCH树脂上，并用PBS和离心洗涤。用 8 M 尿素洗脱显示预期的 O-糖基化铰链肽富集，具有不同程度的糖基化。上海N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究