安徽固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

时间:2024年06月27日 来源:

糖蛋白性能测试:O-聚糖的岩藻糖基化参与功能上重要的聚糖表位的合成,例如血型抗原和刘易斯结构。分析用这种复杂的聚糖结构修饰的糖蛋白可能具有挑战性,需要高效和特异性的酶工具。我们在许多糖基工程TNFR蛋白上测试了Genovis的FucosEXO,这些蛋白携带多达11个O-聚糖,这些O-聚糖以不同的键装饰。我们将该活性与其他市售岩藻苷酶进行了比较。FucosEXO 能够在 1 小时内对所有三种 TNFR 蛋白进行去岩藻糖磺酸处理,而用其他岩藻糖酶处理导致部分去除岩藻糖或根本没有去除。PNGase F 固定化微离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的 PNGase F 酶,用于在z终样品中酶峰减少的糖蛋白上水解 N-糖。安徽固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

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GlycOCATCH®亲和纯化:用于粘蛋白型O-糖蛋白和肽亲和纯化的富集树脂。GlycOCATCH亲和纯化以方便的离心柱形式提供。该产品包含:4 个 GlycOCATCH 亲和纯化微离心柱,每个柱能够结合 50 μg 粘蛋白型 O-糖蛋白(总共 200 μg)。Genovis的SialEXO 冻干 200 单位,用于去除唾液酸;OpeRATOR 冻干 200 单位,用于结合的 O-糖蛋白的可选洗脱方法。1. 靶向 O-糖蛋白富集;2. 复杂样品的特异性净化;3. 用于改进 MS 分析的样品制备。O-糖基化蛋白和肽的特异性富集:O-连接聚糖参与多种生物过程,包括抑制病原体引起的gan染、炎症反应、造血和细胞信号传导。安徽固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究使用游离聚糖方法分析zhiliao性抗体曲妥珠单抗、Fc-融合蛋白依那西普和糖蛋白RNase B的N-聚糖。

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Genovis的GlycOCATCH®是一种亲和树脂,可特异性结合O-糖基化(粘蛋白型)蛋白和肽,从而实现简单的工作流程,以富集和纯化携带O-聚糖的蛋白质和肽。洗涤离心柱,并用8M尿素洗脱结合的蛋白质。对洗脱材料的分析表明,由于洗脱O-糖基化蛋白,并且树脂与非糖基化蛋白和N-糖基化蛋白的结合可以忽略不计。选择性结合 O-糖蛋白:为了测试选择性,将一系列 O-糖基化、N-糖基化和非糖基化蛋白与Genovis的GlycOCATCH 一起孵育。为了在肽水平上研究Genvois的GlycOCATCH的O-糖特异性,将O-glcyosyled肽(糖蛋白)与一系列未修饰的肽混合。

使用Genovis的GalNAcEXO 对 O-糖基化生物制药进行 Tn 抗原表征:未成熟的截短O-聚糖导致了复杂生物制药的异质性,使其分析更具挑战性。 O-聚糖的he心由n-α-GalNAc残基组成,通过糖苷键与丝氨酸或苏氨酸连接,称为Tn抗原。 现在,使用GalNAcEXO可以采用合适的酶策略来去除这些GalNAc并简化生物制药的表征。在质谱图中可以观察到重复峰的模式。其次,在与GalNAcEXO酶孵育后,剩余的GalNAc残基被完全去除,留下一个峰。因此,该工作流程确认了 O-糖基化生物制药上存在 Tn 抗原,并允许定量he心 GalNAc 水平。这种工作流程的另一个好处是减少了剩余的异质性,这有助于确认蛋白质的完整质量,并揭示截短的片段。将OglyZOR酶与依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或没有 SialEXO 孵育 1 小时。

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在Genovis的PNGaseF去除N-聚糖并用SialEXO和GalactEXO截断O-聚糖后,在质谱图中观察到几个与GalNAcs相关的峰。为了去除剩余的GalNAc残基,应用GalNAcEXO酶。用GalNAcEXO处理后观察到的单个蛋白峰显示完全去除剩余的GalNAcs。 GalNAcEXO在生理缓冲液和中性pH值中具有活性,使其与大多数样品相容。此外,GalNAcEXO的活性不依赖于任何可能影响LC-MS分析的辅因子,如BSA。根据底物的性质,糖蛋白的GalNAcEXO反应在2小时内完成,而更复杂的样品可能需要孵育过夜。Genovis的GalNAcEXO也可固定在离心柱中,以便快速方便地处理样品,在制备过程中不会残留酶。O-和N-糖基化蛋白的高效α2-3去唾液酸化可以在1小时内实现。北京PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

GalNAcEXO 在 pH 值 6.0 至 7.6 范围内具有高度活性,来源于Akkermansia muciniphila。安徽固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

OglyZOR 来源于口腔链球菌,在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签,分子量为 227 kDa。SialEXO来源于Akkermansia muciniphila,在大肠杆菌中表达。SialEXO酶含有His标签,组分的分子量分别为42 kDa和66 kDa。1.高效O-糖苷酶;2. 降低样品异质性,揭示潜在的关键蛋白质修饰;3. 完全、稳健地去除 O-糖he心 1 二糖。Genovis的冻干酶,用于水解糖蛋白上的he心1 O-聚糖。OglyZOR 冻干剂以冻干粉的形式提供,装在 2000 个单位的小瓶中,用于在 2 mg 糖蛋白上水解he心 1 O-聚糖。它需要去除唾液酸助剂才能发挥作用,因此与2000单位的SialEXO冻干一起提供。安徽固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

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