江西冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

时间:2024年07月08日 来源:

当在完整状态下进行分析时,EPO的聚糖异质性导致了非常复杂的质谱图。通过在 37°C 下在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时,可以有效地去除 N 糖(含有PNGase F酶)和 O-糖,如对应于未修饰蛋白质的单个峰所示。EPO上残留了少量用乙酰化唾液酸修饰的O-聚糖,因为OmniGLYZOR对这种结构的水解效率低下。根据制造商Genvois的建议(在37°C下进行O/N孵育),两种底物蛋白也用另一种市售的去糖基化产物处理,并显示数据以供比较。另一方面,N-聚糖在内质网中翻译地连接到未折叠的蛋白质上。这导致某些 N-糖基化位点难以被 Genovis的PNGase F 接近,或者一旦底物蛋白折叠成其天然状态,就根本无法接近。因此,这种N-聚糖的水解需要底物蛋白以与酶活性相容的方式变性。复杂样品的特异性净化;改进 MS 分析的样品制备。江西冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

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ImpaRATOR 是一种 O-聚糖依赖性蛋白酶,可催化糖蛋白和糖肽中与糖基化丝氨酸或苏氨酸残基相邻的肽键的水解。它切割用粘蛋白型O-聚糖修饰的丝氨酸或苏氨酸残基的N-末端,包括唾液酸化物种。粘蛋白型O-聚糖是ImpaRAT活性所必需的,该酶不会消化未修饰的丝氨酸或苏氨酸残基,也不会在糖蛋白的N-糖基化位点。该酶接受 O-聚糖结构,包括唾液酸化he心 1 和he心 2 结构以及 Tn 抗原。Genovis的ImpaRATOR 来源于铜绿假单胞菌,在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签,分子量为 97 kDa。广东冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶疾病机理研究OglyZOR酶有效地水解了所有三种底物中的O-聚糖。

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Genvis测试去除唾液酸以揭示电荷变体:唾液酸是带负电荷的糖残基,存在于 N- 和 O-连接的聚糖上。唾液酸的固有电荷可能会使分析工作流程复杂化,从而掩盖其他重要的修饰。Microspin 色谱柱可用于 2 x 0.5 mg、5 x 0.5 mg 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白的去唾液酸化。1. 易于使用的离心柱;2. 提高酶与底物的比例,提高消化效率;3. 样品中不含酶。因此,唾液酸的去除有助于研究蛋白质中的潜在变体。该应用展示了一种快速简便的样品制备方法,可在电荷异构体分析之前去除所有唾液酸。

用于糖蛋白去唾液酸化的冻干酶混合物。Genovis的SialEXO 冻干剂以冻干粉的形式提供,装在 2000 个单位的小瓶中,用于 2 mg 糖蛋白的去唾液酸化。1. 用于方法开发的灵活格式;2. 可以结合酶以提高效率;3. 适用于自动化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。用于水解ɑ2-3-连接唾液酸的冻干酶。 Genovis的SialEXO 2-3冻干剂以冻干粉末的形式提供,装在500个单位的小瓶中,用于0.5mg糖蛋白的去唾液酸化。 与唾液酸酶混合物 SialEXO 相比,SialEXO 2-3 是一种 α2-3 特异性唾液酸酶,允许对 α2-3 连接的唾液酸进行靶向分析。O-和N-糖基化蛋白的高效α2-3去唾液酸化可以在1小时内实现。ImpaRATOR 是一种 O-糖依赖性蛋白酶,可消化携带粘蛋白型O-聚糖的蛋白。

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由于蛋白质的O-糖模式的异质性和O-糖结构的OpeRATOR特异性,形成了重叠的肽,从而可以获得O-糖位点的完整图谱为了进行比较,相同材料的标准胰蛋白酶消化物, 显示难以分析的少量且非常大的糖肽。使用Genovis的OpeRATOR进行O-糖位点定位:OpeRATOR 是一种 O-聚糖特异性蛋白酶,可消化丝氨酸和苏氨酸糖基化位点的粘蛋白型 O-糖蛋白 N 端。这会产生携带O-糖的糖肽,并能够使用质谱法进行O-糖分析、O-糖肽图谱以及中级分析。下面是OpeRATOR消解位点的示意图。FucosEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的FucosEXO酶;江西N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶生物药物开发

OglyZOR 来源于口腔链球菌,在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签,分子量为 227 kDa。江西冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

从依那西普水解β1-3和β1-4半乳糖:Genovis的GalactEXO Immobilized 对 β1-3 和 β1-4 连接的半乳糖均具有酶活性,这些半乳糖存在于装饰有 N- 和 O-连接糖基化的生物制药中,例如 Fc-融合蛋白依那西普。将依那西普与GalactEXO固定化孵育60分钟,并在FabRICATOR消化后使用LC-MS在亚基水平上研究酶活性。TNFR和Fc/2片段分别分析。与GalactEXO Immobilized孵育导致N-连接和O-连接聚糖上的半乳糖残基水解,这在半乳糖基化物种中被视为信号丢失。对游离的N-聚糖分析证实了LC-MS数据。江西冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

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