黑龙江PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

水解O-聚糖的酶不会从变性中获益，这就是为什么OmniGLYZOR色谱柱只能在天然条件下使用的原因。 OmniGLYZOR 试剂盒 Microspin 以含有足够材料的试剂盒形式提供，可使5 × 50-100 μg 或 10 × 50-100 μg 糖蛋白去糖酸化。N-和O-连接聚糖的快速高效；与LC-MS兼容；完全去除聚糖，改进基础蛋白的分析；固定形式可提高酶与底物的比率，从而实现快速去糖基化。 IgdE酶(FabALACTICA®)和PNGaseF酶分别购自Genovis(马萨诸塞州，美国)。用于水解糖蛋白上N-聚糖的冻干酶。Genovis的PNGase F 冻干剂以冻干粉的形式提供，装在 1000 或 5 x 1000 单位小瓶中，分别用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。ImpaRATOR™ 和 OpeRATOR® - 两种协同的作用：共同提供了有关聚糖组成和 O-聚糖位点的完整信息。黑龙江PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

使用Genovis的OpeRATOR图谱O-聚糖位点对依那西普进行LC-MS分析：依那西普是一种 Fc 融合蛋白，具有高度 O-糖基化的铰链区域。将依那西普与OpeRAT一起孵育，并使用LC-MS/MS分析所得糖肽。促红xibao生成素 （EPO） 是一种具有单个 O-糖基化位点的 ~30 kDa 糖蛋白。在PNGase F去除N-糖并使用SialEXO进行去唾液酸化后，用OpeRAT消化天然蛋白，并通过反相LC-MS分析所得蛋白质片段。O-糖基化的位点可以通过识别OeRATOR消化位点直接推断出来。为了获得良好性能，需要去除唾液酸助剂，因此购买中包括2000个单位（如果SialEXO冻干）。1. 用于方法开发的灵活产品形式；2. 可以结合酶以提高效率；3. 适用于自动化工作流程；4. 即用型 - 只需加水即可。O-聚糖是OpeRATOR活性所必需的，而该酶在N-聚糖上没有活性。OpeRATOR和SialEXO处理后，O-糖基化蛋白被消化成携带O-聚糖的肽。消化发生在O-糖基化位点的N端。黑龙江固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究PNGase F Automation 含有以自动化友好的 96 孔板形式冻干的 PNGase F 酶。

GlycOCATCH®亲和纯化：用于粘蛋白型O-糖蛋白和肽亲和纯化的富集树脂。GlycOCATCH亲和纯化以方便的离心柱形式提供。该产品包含：4 个 GlycOCATCH 亲和纯化微离心柱，每个柱能够结合 50 μg 粘蛋白型 O-糖蛋白（总共 200 μg）。Genovis的SialEXO 冻干 200 单位，用于去除唾液酸；OpeRATOR 冻干 200 单位，用于结合的 O-糖蛋白的可选洗脱方法。1. 靶向 O-糖蛋白富集；2. 复杂样品的特异性净化；3. 用于改进 MS 分析的样品制备。O-糖基化蛋白和肽的特异性富集：O-连接聚糖参与多种生物过程，包括抑制病原体引起的gan染、炎症反应、造血和细胞信号传导。

genovis的FucosEXO在生理缓冲液和中性pH值中具有活性，使其与大多数样品相容。此外，FucosEXO活性不依赖于任何可能影响LC-MS分析的辅因子，如BSA。根据底物的性质，FucosEXO 可在 1 至 2 小时内水解糖蛋白上的末端 α1-2,3,4 连接的岩藻糖残基，而对于非常复杂的样品可能需要更长的孵育时间。FucoseEXO也可固定在离心柱中，可快速方便地处理高达0.5mg的糖蛋白。使用离心柱形式，将糖蛋白样品与固定化的FucosEXO树脂一起孵育，然后在离心步骤中轻松收集消化的糖蛋白。评价抗体片段对完整蛋白聚集的影响：可使用Genovis的IgdE酶（FabALACTICA®）和PNGaseF酶。

当在完整状态下进行分析时，EPO的聚糖异质性导致了非常复杂的质谱图。通过在 37°C 下在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时，可以有效地去除 N 糖（含有PNGase F酶）和 O-糖，如对应于未修饰蛋白质的单个峰所示。EPO上残留了少量用乙酰化唾液酸修饰的O-聚糖，因为OmniGLYZOR对这种结构的水解效率低下。根据制造商Genvois的建议（在37°C下进行O/N孵育），两种底物蛋白也用另一种市售的去糖基化产物处理，并显示数据以供比较。另一方面，N-聚糖在内质网中翻译地连接到未折叠的蛋白质上。这导致某些 N-糖基化位点难以被 Genovis的PNGase F 接近，或者一旦底物蛋白折叠成其天然状态，就根本无法接近。因此，这种N-聚糖的水解需要底物蛋白以与酶活性相容的方式变性。在天然条件下使用OmniGLYZOR Microspin色谱柱，可在3小时内有效去除C1 抑制剂O-聚糖。冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发

用于水解天然 N-和 O-糖基化蛋白或游离寡糖上的α1-2、α1-3和α1-4-连接岩藻糖残基。黑龙江PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

用于糖蛋白去唾液酸化的冻干酶混合物。Genovis的SialEXO 冻干剂以冻干粉的形式提供，装在 2000 个单位的小瓶中，用于 2 mg 糖蛋白的去唾液酸化。1. 用于方法开发的灵活格式；2. 可以结合酶以提高效率；3. 适用于自动化工作流程；4. 即用型 - 只需加水即可。用于水解ɑ2-3-连接唾液酸的冻干酶。 Genovis的SialEXO 2-3冻干剂以冻干粉末的形式提供，装在500个单位的小瓶中，用于0.5mg糖蛋白的去唾液酸化。 与唾液酸酶混合物 SialEXO 相比，SialEXO 2-3 是一种 α2-3 特异性唾液酸酶，允许对 α2-3 连接的唾液酸进行靶向分析。O-和N-糖基化蛋白的高效α2-3去唾液酸化可以在1小时内实现。黑龙江PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究