陕西IdeS蛋白酶蛋白组学

时间:2024年10月04日 来源:

样品制备的条件可能会在样品中诱发伪影,因此需要避免高温和碱性pH值进行质谱分析。如果可能的话,避免多个步骤并在一锅反应中进行消化和还原也可能是有益的。与IdeS不同,为了探索Genovis的GingisREX对离液剂和去液剂的稳定性和耐受性,在一系列试剂中测试了酶活性,并使用底物测定进行了评估。数据显示,GingisREX在6M时耐受尿素,吐温高达1%,但活性在0.1%时受到SDC的负面影响。该酶在 pH 值范围为 5.0 至 9.0 时显示出活性,在 pH 值为 6.5-8.0 之间。综上所述,GingisREX可用于一锅反应,以同时消化和变性6M尿素。与Genovis的IdeS不同,双特异性 T 细胞接合器 (BiTE) 分子是一种融合蛋白疗法,其中两个 scFv 融合,形成一个双特异性分子,其中一个 scFv 靶向细胞毒性 T 细胞,另一个靶向Ai症抗原。该蛋白质由四个蛋白质结构域组成,两个 scFv 均由 VL 和 VH 区域组成,总共由三个柔性 GS 连接子连接。这种蛋白质的大尺寸(54 kDa)可能对通过完整质谱法进行产品质量监测构成挑战,因为标准MS仪器可能无法提供蛋白质的单同位素分辨率。IgASAP Sub1 可水解分泌物和血清 IgA1。陕西IdeS蛋白酶蛋白组学

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与IdeS不同,Genovis的GingisKHAN(Kgp)是一种半胱氨酸蛋白酶,可在铰链上方的单个位点(KSCDK/THTCPPC)消化人IgG1,产生完整且均质的Fab和Fc片段。GingisKHAN是一种赖氨酸特异性蛋白酶。单一的消化位点是人IgG1三维结构的结果,使这种赖氨酸暴露于酶中。如果去除N-聚糖,则Fc上暴露的赖氨酸处可能会出现额外的消化位点。GingisKHAN需要温和的还原条件才能具有活性,并且在37°C和pH8下获得活性。还原剂(2mM半胱氨酸)与酶一起提供。GingisKHAN是从牙龈卟啉单胞菌中纯化的。该酶用于使用LC-MS表征基于抗体的生物zhiliao药物,研究Fc聚糖分析、双特异性抗体、亲和力和亲和力效应,并鉴定翻译后修饰。安徽FabULOUSIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶Genovis发现更多的缓冲液与FabRICATOR活性兼容。

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Genovis的FabRICATOR是一种半胱氨酸蛋白酶,它对许多不同的物种和IgG亚类都有活性,包括人IgG亚类1-4以及猴子、兔子、大鼠和绵羊IgG的一些亚类。FabRICATOR在铰链下方的单个位点进行消化,生成F(ab’)2和Fc/2子基,可以进一步还原生成Fd’,轻链和F/2子基是必需的。FabRICATOR(IdeS)通过蛋白-蛋白相互作用与目标抗体工作,这说明了它的高特异性。事实上,它在单个位点消化意味着使用FabRICATOR时没有过度消化的风险,其高特异性也意味着相同的消化方案可以作为平台方法应用于许多不同的抗体。FabRICATOR(IdeS)不需要还原条件来获得良好活性,也不需要任何额外的辅助因子,它将在不同生理缓冲中发挥作用。这意味着按照下面的铰链消解,您将生成F(ab’)2和Fc/2片段用于分析或其他应用。

用于IgA1和IgA2m1以上铰链消化的冻干酶。与IdeS不同,Genovis提供的IgASAPSub1+2在铰链上方的一个特定位点消化人IgA1和IgA2m1,产生完整且均匀的Fab和Fc片段。由于人IgA1的铰链比IgA2的铰链长,因此IgA1和IgA2m1之间来自消化位点的氨基酸C末端不同。IgASAPSub1+2可消化分泌物和血清IgA。孵育时间为过夜(16-18小时),并且由于酶的特异性,没有过度消化的风险。该酶在pH值为6.0至8.0时具有活性,不需要还原条件或辅助因子即可产生活性。活性为37°C。IgASAPSub1+2是从丹毒梭菌克隆而来的,并在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为131kDa。IgASAPSub1+2冻干剂以冻干粉的形式提供,装在1000个单位的小瓶中,用于消化1mgIgA1和IgA2m1。Genovis的IgASAP 是 IgA 消化酶家族。

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Genovis的FabRICATOR MagIC自动样品制备可用于分析和监测不同的CQA。mAb在生产或储存过程中的氧化就是这样一种CQA,可能会影响zhiliao产品的质量。为了展示FabRICATOR MagIC如何解决这个问题,对6种mAb的混合物进行强制降解(室温下3个月),并通过反相LC-MS进行分析。当在完整水平上分析mAb时,可以检测到mAb5丰度的显着差异,同时出现许多新的峰。然而,无法获得可靠的质量数据。使用FabRICATOR MagIC,mAb5变化的来源在Fab区域内。随后还原为 Fc/2、LC 和 Fd' 片段,可以识别差异是由于 mAb5 Fd' 片段上的色氨酸氧化,通过形成氧代内酯 (+14 Da) 和二氧代内酯 (+30 Da) 以及 mAb5 LC (-18 Da) 的琥珀酰亚胺化来揭示。此外,还可检测到mAb3轻链的异构化。该示例说明了FabRICATOR MagIC在mAb中级分析中的强大功能,它创建的片段足够小,可以精确定位特定的修饰,而无需耗时耗费资源的肽图分析,所有这些都以相对较少的手动操作时间快速完成。消化在1小时内完成,且具有特异性。即使孵育时间延长,也没有过度消化的风险。陕西IdeS蛋白酶蛋白组学

在抗体及核酸药领域,倍笃生物产品线涵盖药物研发的全流程,抗体结构域分析蛋白酶、蛋白聚糖分析水解酶。陕西IdeS蛋白酶蛋白组学

在Genovis,我们的策略是帮助客户进行中级(或亚基)分析,这是我们的工作,特别是我们的蛋白质酶切产品。完整质量和肽图谱是蛋白质表征的常用方法,我们发现,与简单但信息有限的完整质量和高度复杂但信息丰富的肽图谱相比,中级方法具有优势。通过执行中级描述,您可以生成从完整的质量实验中获得的所有信息,具有额外的优势。在对抗体进行完整质量分析时,很难明确地识别某些修饰。质谱仪器正在改进,可以更有效地分析更大的分子,但通过使用我们的SmartEnzymes,如IdeS,可以将抗体分解成更小的片段,这提高了这些实验可以执行的分辨率,因此,增加了鉴定修饰的信心。此外,你不仅能够更好地识别修改,而且你能够将它们定位到蛋白质上的单个结构域,这是你在完整水平上无法做到的。陕西IdeS蛋白酶蛋白组学

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