上海广州永诺数字PCR简介

时间:2020年09月05日 来源:

研究方向

无创产前筛查

无创伤的产前诊断, 如21号染色体为3倍体的唐氏综合征、已知父母基因型的胎儿地贫检测或已知父母基因型的其它核酸病检测(孟德尔相关遗传疾病)。目前标本来源主要为血液,而待检测的胎儿DNA受到母体DNA的干扰,影响了检测的准确性。而QX200检测系统独特的微滴化技术完全可以作为二代测序法的补充来进行的无创伤产前诊断,从而提高工作效率及节约成本。

转基因食品或成分的检测

目前在确定转基因作物或成分的含量时采取定量PCR的标准曲线法,这种方法需要依赖于已知浓度的标准品(Certified Reference Materials Calibrants, CRMCs)。ddPCR***定量的方式可以彻底解决这些标准物质的定标工作。 准确的定量结果和优异的重复性。上海广州永诺数字PCR简介

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dPCR的基本原理

目前dPCR主要有两种形式,芯片式和液滴式,但基本原理都是将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或微滴中,每个反应器的核酸模板数少于或者等于1个。这样经过PCR循环之后,有一个核酸分子模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器就没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,就可以推算出原始溶液的核酸浓度。 北京广州永诺数字PCR代理商采用有限稀释的方法将目标分子分割到**的反应体系中。

可以使用几种不同的方法来分配样品,包括微孔板,毛细管,油乳剂和带有核酸结合表面的小型化腔室阵列。样品的分配使人们可以通过假设分子种群遵循泊松分布来估计不同分子的数量,根据泊松分布的原理,反应体系中目标分子的拷贝数可以通过公式A=-ln[(N-X)/N]*N计算,从而解决了多个目标分子存在于单个液滴中的可能性。
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基本原理
数字PCR的特点
微滴式数字PCR主要是通过对PCR反应体系
进行液相的有限稀释——将一个体系分割为数万
个以上皮升级的微滴,每个微滴即一个**的反
应单元,每个反应单元所含的DNA模板分子个数
符合泊松分布数学模型,***通过测定每个反应
单元的荧光信号并结合泊松分布计算出测定样本
的***拷贝数。
***定量,不依赖Ct值,无需标准曲线。
超高灵敏度,适用于稀有序列及稀有突变的检测。
精细的定量结果和较好的重复性
适用复杂样品检测,不易受PCR***物影响。
兼容染料法和探针法,同时满足科学研究和临床检测要求。


数字PCR检测及分析原理在上世纪90年代就被提出来了,但是无奈受限于当时的技术条件,样本稀释及分配都是靠手工来完成的,受到很多因素的干扰和限制;并且结果分析对于研究者来说也十分枯燥与繁琐,因此在很长一段时间dPCR发展停滞不前。后来由于微流控技术与微纳集成制造工艺的发展解决了dPCR过程中的几个关键技术问题,推动了dPCR的研究与商业化的发展。


目前根据dPCR样本稀释分配的方式,基本可分为三大类,一种是基于大规模集成微流控芯片;第二种是使用微反应室/孔板;第三种是微滴式。但不论是走芯片式还是微滴式,其基本原理都是将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或者微滴当中,每个反应器的核酸模板数少于1或者等于1。经过PCR扩增之后,有一个核酸分子的模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,可以推算出原始溶液的核酸浓度。 流式检测,顺序逐一检测每个微滴,无荧光交叉干扰,微滴阴性阳性判读准确。

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无创产前检查

镰状细胞贫血(sickle cell anemia)是HBB基因突变引起的常染色体显性遗传病,有严重的危害,可以导致高达5%的胎儿死亡率及4.62%的孕妇死亡率。而精细有效的无创产前诊断是预防镰状细胞贫血患儿出生的有效方法。研究人员采用dPCR技术检测孕妇胎儿游离DNA(cff-DNA)HBB基因突变。结果显示,dPCR技术能够确定87%的男性胎儿(n=45)和75%的女性胎儿(n=20)HBB基因的突变状态。当cff-DNA浓度大于7%时,可以**的检测出HBB基因突变[3],可以说是相当厉害了。



支持多重数字PCR,可选全中文分析软件。上海微流控芯片数字PCR简介

CRISPR-Cas9基因编辑结果验证。上海广州永诺数字PCR简介

与常规PCR方法相比,数字PCR有如下优势:

  1. 能够***定量:常规PCR定量需要制定已知拷贝数的标准DNA曲线,但是由于待检样本与标准曲线不在统一体系,条件上会存在差异,另外加上PCR扩增效率的差异从而影响定量结果的准确性。而数字PCR不受标准曲线和扩增动力学影响,可进行***定量。

  2. 样本需求量低:适用于珍贵样本或核酸降解严重的样本

  3. 灵敏度高:数字PCR是将传统PCR反应体系分割成数万个**PCR反应,这些反应可以精确地检测很小的目的片段差异、单拷贝甚至低浓度的混杂样本。且能避免非同源异质双链的形成。

  4. 高耐受性:由于目的序列被分配到多个**反应体系中,***降低了背景信号和***物对反应的干扰,扩增基质效应大大减小。 上海广州永诺数字PCR简介

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