数字PCR简介

时间:2020年11月03日 来源:

目前数字PCR技术在临床领域已经有着非常***且***地应用,例如在病原微生物检测中的应用:HBV检测、HIV检测、甲型流感病毒检测等;在产前诊断中的应用:13/18/21号染色体三倍体检测、遗传性耳聋检测、地中海贫血检测及优生五项的病毒检测等;在**靶向***相关基因检测中的应用:肺*EGFR基因突变、ALK基因融合检测、结直肠*KRAS、BRAF基因突变检测、乳腺*HER2基因扩增检测、神经胶质瘤IDH基因突变检测等。以**靶向***相关基因检测为例,在**形成的超早期,会出现**细胞的坏死和凋亡,这些凋亡或坏死的**细胞会释放其DNA进入外周血,因此通过分析循环血液中是否含有**特异的游离DNA就可以达到**早期筛查的目的。然而此时DNA含量极低,对检测的灵敏度和精确性要求极高,目前只有数字PCR技术可以检测出来。另外进行个体化***时,需要对基因组样本进行分析,此时利用数字PCR技术也能**提高结果的可信性,进而建立合理***方案。
FAM、VIC双通道荧光检测。数字PCR简介

数字PCR简介,数字PCR

微滴式数字PCR系统为微流控微滴生成技术,采用原创性的油液,单个样本在微米级流道中利用气压驱动在3分钟内生成10万微滴,单次运行生成80万微滴,微滴体积达皮升级,检测线性范围达到6个数量级,各项指标均超越国内外主流产品。

在液滴生成数上,MicroDrop™能达到国外同级别产品的5倍。与此同时,设备制作成本只有国外同类产品的一半。这减低了精细医疗的成本,打破了国外厂商在微滴式数字PCR领域的垄断。这意味着在未来,采用外周血、唾液、尿液、脑脊液等样本进行低成本、高灵敏、快速的无创检测成为可能。 广州广东数字PCR解决方案双通道荧光检测,支持EvaGreen染料及探针法。

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微滴式数字PCR系统在传统的PCR扩增前对样品进行微滴化处理,即将含有核酸分子的反应体系分成成千上万个纳升级的微滴,其中每个微滴或不含待检核酸靶分子,或者含有一个至数个待检核酸靶分子。经PCR扩增后,逐个对每个微滴进行检测,有荧光信号的微滴判读为1,没有荧光信号的微滴判读为0,根据泊松分布原理及阳性微滴的个数与比例即可得出靶分子的起始拷贝数或浓度。

与传统PCR相比所具有的优势

不依赖Ct值或内参基因,即可确定低至单拷贝的待检靶分子的***数目。微滴技术让数字PCR更低成本,且更实用。



研究方向

二代测序辅助建库

目前靶向测序建库方法包括扩增子方法,在均相溶液中,当扩增引物增加时,由于扩增引物之间的相互作用,从而影响扩增的效率;如果将其分散到大量微液滴中扩增,将可**降低引物间相互作用,提高扩增效率。同时还可以实现对于少量模板的有效扩增,得到更多的有效测序数据。

CRISPR-Cas9基因编辑结果验证

CRISPR-Cas9技术的发明,是基因编辑技术的一大突破,但如何验证实验是否成功,仍需要高灵敏度的检测方法,数字PCR技术可以满足这一需求。Broad研究所张锋团队发明了以CRISPR为基础的SHERLOCK技术可以对核酸进行高灵敏度的定性检测,但精确定量评估时仍采取了数字PCR进行确认。 正压生成油包水的液滴。

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数字PCR(Digtal PCR)是一种核酸定量精密检测的新兴技术手段,于20世纪由Vogelstein等提出。它是将稀释后的核酸模板分配到大量不同的反应单元中,使每个反应单元中有一个或没有核酸。利用PCR扩增的同时,加入可检测荧光。待扩增结束时,使用统计学方法采集每个反应单元出现的荧光次数,从而定量检测样本中的核酸浓度。

基于分液方式的不同,数字PCR主要分为3种:微流体数字PCR(Microfluidic digital PCR,mdPCR)、微滴数字PCR(Droplet digital PCR,ddPCR)和芯片数字PCR(Chip digital PCR,cdPCR)。 MicroDrop™数字PCR可广泛应用于科研、医疗、出入境检验检疫等领域。杭州广东数字PCR代理商


不依赖Ct值,无需标准曲线。数字PCR简介

定量PCR和数字PCR的特点:


1. 在20多年的使用和发展中,定量PCR作为一种技术平台,已经产出海量的数据,在工业界和分子检测的某些应用上,定量PCR已经成为“金标准”。基础研究方面,则形成了被称为MIQE的“定量PCR标准实验指南”。   
2. 在定量PCR的各种应用中,基因表达分析(gene expression analysis)的应用比重约占七成,综合各种因素来看,眼下定量PCR还是进行基因表达研究的理想手段。   
3. 上述的“各种因素”具体展开,主要包括:通量、自动化程度、各种检测探针与染料、检测通道、成本和可参考文献与protocol的数目等等。   
4. 就目前市场上已有的数字PCR设备来看,定量PCR在检测的线性范围上具有优势,意味着同一个run内可对各种表达丰度的样品进行分析。



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