南通流式数字PCR解决方案

时间:2020年12月12日 来源:

研究方向

无创产前筛查

       无创伤的产前诊断, 如21号染色体为3倍体的唐氏综合征、已知父母基因型的胎儿地贫检测或已知父母基因型的其它核酸病检测(孟德尔相关遗传疾病)。目前标本来源主要为血液,而待检测的胎儿DNA受到母体DNA的干扰,影响了检测的准确性。而QX200检测系统独特的微滴化技术完全可以作为二代测序法的补充来进行的无创伤产前诊断,从而提高工作效率及节约成本。


转基因食品或成分的检测

       目前在确定转基因作物或成分的含量时采取定量PCR的标准曲线法,这种方法需要依赖于已知浓度的标准品(Certified Reference Materials Calibrants, CRMCs)。ddPCR***定量的方式可以彻底解决这些标准物质的定标工作。 MicroDrop™数字PCR平台是由永诺生物自主研发并已投入生产的微滴式数字PCR检测系统。南通流式数字PCR解决方案

南通流式数字PCR解决方案,数字PCR

MicroDrop-100数字PCR有什么优势?

       1.MicroDrop-100数字PCR所产生的微滴数是目前市面微滴式数字PCR里相对较高的产品,可将样品分割为10万份,更符合泊松分布数学模型,可以忽略更多的误差因素;此外,高微滴数在多重数字PCR上的优势也会更大。

       2.数字PCR可选全中文界面,对国内用户十分友好,可以说,拿到即可上手。

       3.数字PCR是一个开放性的平台,在试剂方面除了产品列表上的检测试剂盒,还有通用的反应预混液,客户自行设计引物探针即可进行新项目的检测。此外,永诺非常欢迎进行定制、合作开发检测试剂盒。


流式数字PCR准确的定量结果和优异的重复性。

南通流式数字PCR解决方案,数字PCR

研究方向

       低丰度及稀有序列的精确定量

       目前对于低丰度目标序列的检测,定量PCR、杂交、毛细管测序及NGS等方法都因受到背景DNA的干扰,使得检测灵敏度及精确性都达不到精细定量的要求(如定量PCR检测中Ct值大于33的情况下,其重复性就不是很高), 而微滴式数字PCR系统通过**的微滴  化处理,使得稀有的核酸序列从大量的背景DNA中分离出来,从而提高了检测的灵敏度及重复性。

       此外,由于样品微滴化处理的同时,也将样品中可能存在的***剂进行了分装,提高了数字PCR扩增对于***剂的耐受程度,因此可具体应用于很多临床样品(血液、尿液、粪便、痰液、脑脊液等)中对**核酸标记物的检测。一般而言,毛细管电泳和定量PCR的检测灵敏度约在10%;NGS的灵敏度可达到1%;而ddPCR的检测下限为0.001%。

       数字PCR检测及分析原理在上世纪90年代就被提出来了,但是无奈受限于当时的技术条件,样本稀释及分配都是靠手工来完成的,受到很多因素的干扰和限制;并且结果分析对于研究者来说也十分枯燥与繁琐,因此在很长一段时间dPCR发展停滞不前。后来由于微流控技术与微纳集成制造工艺的发展解决了dPCR过程中的几个关键技术问题,推动了dPCR的研究与商业化的发展。


       目前根据dPCR样本稀释分配的方式,基本可分为三大类,一种是基于大规模集成微流控芯片;第二种是使用微反应室/孔板;第三种是微滴式。但不论是走芯片式还是微滴式,其基本原理都是将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或者微滴当中,每个反应器的核酸模板数少于1或者等于1。经过PCR扩增之后,有一个核酸分子的模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,可以推算出原始溶液的核酸浓度。 数字PCR技术是公认的液体活检领域灵敏度比较好的检测方法。

南通流式数字PCR解决方案,数字PCR

       数字PCR是一种核酸分子***定量技术。当前核酸分子的定量有三种方法,光度法基于核酸分子的吸光度来定量;,Ct值就是指可以检测到荧光值对应的循环数;数字PCR是***的定量技术,基于单分子PCR方法来进行计数的核酸定量,是一种***定量的方法。主要采用当前分析化学热门研究领域的微流控或微滴化方法,将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或微滴中,每个反应器的核酸模板数少于或者等于1个。这样经过PCR循环之后,有一个核酸分子模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器就没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,就可以推算出原始溶液的核酸浓度。基因表达差异的监测。常州广州永诺数字PCR现货

单张芯片一次可处理8个样本。南通流式数字PCR解决方案

与常规PCR方法相比,数字PCR有如下优势:

1、能够***定量:常规PCR定量需要制定已知拷贝数的标准DNA曲线,但是由于待检样本与标准曲线不在统一体系,条件上会存在差异,另外加上PCR扩增效率的差异从而影响定量结果的准确性。而数字PCR不受标准曲线和扩增动力学影响,可进行***定量。

2、样本需求量低:适用于珍贵样本或核酸降解严重的样本。

3、灵敏度高:数字PCR是将传统PCR反应体系分割成数万个**PCR反应,这些反应可以精确地检测很小的目的片段差异、单拷贝甚至低浓度的混杂样本。且能避免非同源异质双链的形成。

4、高耐受性:由于目的序列被分配到多个**反应体系中,***降低了背景信号和***物对反应的干扰,扩增基质效应大大减小。 南通流式数字PCR解决方案

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