上海双螺旋生物仪器数字PCR品牌

时间:2023年04月08日 来源:

PCR已成为分子诊断领域重要的技术手段之一,占据分子诊断市场的半壁江山。数字PCR是一代PCR技术,也是当前灵敏度和定量精度比较高的分子检测技术。但数字PCR使用成本仍然相对较高,检测靶点数少(一般≤6靶点/反应),阻碍了其在临床中的大规模应用,提高数字PCR的多重检测能力迫在眉睫。基于荧光通道数的增加和基于探针浓度梯度增加,均可以在一定程度上提高数字PCR检测重数,然而只能达到"线性"增加的目的。基于探针浓度梯度的多重检测技术虽然光'f明显增加多重能力,但由于无法避免交叉反应现象,不能确保获得位点特异性的分簇,因此稳定性不足、灵敏度较差,难以满足临床级别的数据要求。而基于创新的且数字PCR独特适用的荧光编码技术可以实现“指数”级的多重检测,颠覆性的提高数字PCR检测重数,覆盖临床应用多场景需求。数字PCR等新兴技术要在临床应用上得到爆发式增长,有赖于LDT市场的放开。上海双螺旋生物仪器数字PCR品牌

数字PCR技术的出现不是为了完全取代原有分子诊断技术,而是更好的补充和完善现有技术平台。数字PCR为不同应用场景下的多样化核酸检测需求提供了新的思路,尤其是在临床检测方面,在 性疾病早期检测、 疾病的伴随诊断、生殖遗传筛查等领域展现出良好的应用前景。国产数字PCR企业在商业化应用方面,也不断“攻城略地”。新羿生物在检测及 疾病伴随诊断方面开发了一系列试剂盒,并积极推进注册临床试验;领航基因聚焦在血流 (脓毒症)及呼吸道 领域,相继推出了多款病原菌检测试剂盒;锐讯生物聚焦于检测,2020年其产品获得FDA紧急授权。除此之外,在公共卫生领域,国产数字PCR企业针对食源性致病菌、鼠疫、虫媒病毒等,也推出多种检测试剂盒。珠三角国产数字PCR荧光通道数字PCR在检测珍贵样品和样品核酸存在降解时具有明显的优势。

ThermoFisherQuantStudio3D是另一个经典的芯片式数字PCR平台,其基本的检测流程是:将反应液加入到涂布器中,通过涂布器将反应液均匀涂布在有20000个微孔的芯片上,将芯片放在PCR仪上扩增,将芯片放入读取仪中采取拍照的方式读取荧光信号。操作较为复杂,整个过程在封闭的芯片中进行,污染的风险较低。STILLANaica是一个较新的数字PCR平台,基本的检测流程是:将反应液加入芯片,将芯片放入微滴生成扩增系统,生成30,000个微滴单层平铺于芯片中,PCR扩增在芯片上完成。然后将扩增后的芯片转移至微滴阅读分析系统,采取拍照的方式读取荧光信号。由于整个过程在封闭的芯片中进行,污染的风险较低。

在使用dPCR进行转基因检测时,通常直接参照qPCR的方法。使用不同技术对相同样品检测时,两种方法的灵敏度是否具有可比性成为关注的问题。Burns等21]使用Fluidigm公司的12.765(12板,每板765个微单元)芯片数字PCR分析仪测定标准物质ERM-AD413检测转基因玉米MON810。该小组应用dPCR技术评估在qPCR定义下的灵敏度数值,在拷贝数200-700之间,dPCR与qPCR的测量结果具有一致性。但与qPCR的灵敏度相比,dPCR在低于拷贝数200时有被低估的风险,在高于拷贝数1000时有被高估的风险。dPCR在同一阵列上同时测量转基因和内源性靶点时,需要稀释内源性靶点和转基因靶点在合理拷贝数范围内以保证dPCR测量结果的准确性。通过创新技术微流控芯片,让数字PCR单反应耗材价格进入个位数,实现了新的进步,也降低开发难度。

数字PCR实验步骤包括:1)试剂配制:将10xdPCRBuffer、dPCR酶、引物和探针、无核酸酶水混合成dPCR预混液,并分装到8联排管中或96孔板中;将各待测样本的核酸模板、阳性对照、阴性对照分别加入相应的8联排管中或96孔板中;2)芯片进样:在小海龟BioDigital·青全自动样品处理系统上进行芯片上反应液进样和液滴生成;3)芯片扩增:在小海龟BioDigital·青PCR扩增仪上进行芯片上PCR扩增反应;4)芯片阅读:在小海龟BioDigital·青生物芯片阅读仪上进行芯片上荧光信号阅读;5)数据分析:使用生物芯片数据分析·青软件进行数据分析和报告导出;3D数字PCR是基于纳米流体芯片进行检测,通过一次检测,将样品分到数千个单独的PCR。法国赛默飞数字PCR品牌

Drop-off数字PCR检测方法的**主要优势是能够能够在一个反应中检测到基因组序列范围短的同源基因突变。上海双螺旋生物仪器数字PCR品牌

在荧光定量PCR应用已经如此的情况下,缘何数字PCR仍然能横空出世?中心点在于荧光定量PCR尽管为科研和临床市场应用提供了非常重要的检测工具支撑,但仍然有尚未被满足的客户需求。荧光定量PCR需要基于标准品制作的标准曲线进行定量,属于相对定量,操作较为复杂,且终端用户对其结果的重复性、灵敏性、精密度、分辨率、对PCR反应抑制剂的耐受性等方面有更高的期待。数字PCR通过将反应体系进行有限稀释至成千上万的反应单元中,实现了核酸靶标的单分子扩增。PCR扩增结束后,基于终点法对阳性液滴数和总液滴数进行计数,结合泊松分布原理,从而实现对起始样本的定量。其极大地简化了操作步骤,并且大幅提高了检测性能,尤其在低丰度或较低丰度的核酸检测上(灵敏性可达0.001-0.0001%),其优异的性能得到了终端用户的认可。上海双螺旋生物仪器数字PCR品牌

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