上海灵敏度qPCR仪采购

时间:2023年06月04日 来源:

qPCR的实质就是PCR反应,只是在扩增产物上增加了荧光标记,通过仪器对荧光信号进行采集。荧光信号的强度与扩增得到的dsDNA的浓度成正比,因此非理想条件下的PCR荧光强度Rn=R0+YnRs=RB+Y0(1+Ex)^nRs (Rn:第n次循环时荧光信号强度,R0:背景信号强度,Rs:每个分子的荧光强度),通过对采集荧光信号就能进行初始模板定量、基因表达量的研究。通过对PCR过程中荧光信号的实时监测,荧光强度的变化趋势,呈现出一条S型曲线即“扩增曲线(Amplication plot)”,分为四个时期:基线期、指数扩增期、线性增长期、平台期。PCR反应需要五种关键试剂:PCR模板、DNA聚合酶、引物、脱氧核苷酸三磷酸(dNTPs)、PCR缓冲液。上海灵敏度qPCR仪采购

PCR方法:PCR的原理在这里不需要进一步解释。多年来,研究人员基于此开发了一系列衍生技术。当前的PCR方法可分为三类:终点PCR,qPCR和dPCR。终点PCR:端点PCR是原始,简单的PCR方法,并且仍然被使用。PCR反应完成后,用户只能通过凝胶电泳,毛细管电泳等方法检测产物。终点PCR本身无法量化,因为反应产生的DNA数量可能无法反映初始情况。例如,不同样品和序列之间的扩增效率存在差异。DPCR通常更准确。 qPCR可以轻松区分两倍的浓度差异(例如5个拷贝和10个拷贝),但是面对小的差异,它却较弱。 dPCR理论上可以识别相差少于20%的拷贝数,例如5和6拷贝。该准确度对于量化涉及染色体重排的基因的拷贝数或量化患者血液中的循环生物学指标特别有用。由于dPCR相当于在反应结束时稀释样品并读取数据,因此dPCR比qPCR对抑制剂的抵抗力更高。单通道qPCR仪设置Quantagene q225 系列荧光定量PCR 系统主要特点:精确定量、快速高效、小巧轻便。

TwoSteprt-pcr和OneSteprt-pcr的选择RealTimeRT-PCR反应可选择TwoSteprt-pcr反应或OneStepRT-PCR反应,TwoStepRT-PCR反应是将反转录反应和RealTimePCR反应分两步进行。进行TwoStepRT-PCR反应时,可选择RandomPrimer、OligodtPrimer或基因的特异性引物进行反转录反应,然后再将一部分反转录反应液(cDNA)作为模板添加到RealTimePCR反应液中。使用反转录引物时可以根据实验目的选择合适的反转录引物,如果选择RandomPrimer或OligodtPrimer,合成的cDNA可用于复数种类基因的检测,cDNA溶液可以稳定地长期保存,供以后解析使用。OneSteprt-pcr的反转录反应和PCR反应在同一反应管内连续进行,操作简单,污染几率低。但此时的反转录反应和PCR反应都并非为各自的适条件,所以OneSteprt-pcr通常比TwoStepRT-PCR反应效率低。此外,与TwoStepPCR反应相比,反转录酶等的使用量多,每个反应的成本相对较高。OneSteprt-pcr反应的反转录反应引物只能使基因的特异性PCR下游引|物,而不能使用Randomprimer或OligodtPrimer共用引物。基因表达解析等绝大部分RT-PCR,适合选择TwoSteprt-pcr反应,而RNA病毒检测等以基因检测为目的RT-CR反应,应优先考虑防止污染,所以比较好选择OneSteprt-pcr反应。

利用SYBR Green I可以检测PCR反应中获得的全部双链DNA,但是不能区分不同的双链DNA。为了进一步确保荧光检测的就是靶DNA序列,人们又设计了能与目的DNA序列特异结合的荧光探针,如TaqMan探针。TaqMan探针是一小段被设计成可以与靶DNA序列中间部位结合的单链DNA(一般为50-150 bp),并且该单链DNA的5'和3'端带有短波长和长波长两个不同荧光基团。这两个荧光基团由于距离过近,在荧光共振能量转移(FRET)作用下发生荧光淬灭,因而检测不到荧光。PCR反应开始后,随着双链DNA变性产生单链DNA,TaqMan探针结合到与之配对的靶DNA序列上,并被具有外切酶活性的Taq DNA聚合酶逐个切除而降解,从而解除荧光淬灭的束缚,荧光基团在激发光下发岀荧光,所产生的荧光强度直接反映了被扩增的靶DNA总量。PCR 反应中通过控制温度变化使得核酸分子重复地解链与延伸,从而实现对目的片段的指数扩增。

TaqMan探针法是探针分子,TaqMan探针是单链DNA,5’端偶联发光基团,3’端偶联淬灭基团,游离的完整探针是检测不到荧光信号的,发光基团发出的荧光会被淬灭基团吸收淬灭,探针被水解,发光基团和淬灭基团远离就可以检测到荧光信号。反应开始时,模板链经热变性解链形成单链,TaqMan探针优先跟模板链退火,引物随后退火到模板上,之后进行链的延伸,延伸过程中Taq酶发挥5’-3’外切酶活性,遇到探针会从5’端逐个碱基切除探针,发光基团会跟淬灭基团分开,因此荧光检测系统可以接收到荧光信号,每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,荧光信号的累积和PCR产物形成是同步的。TaqMan探针法的特异性除了由引物提供,更由探针分子保证,因其退火温度更高,所以TaqMan探针法特异性更好,在一个反应体系中加入多条探针,可以做多个基因同时检测。qpcr在扩增每个循环中模板DNA通过变性、复性、延伸三个阶段形成更多的子代DNA,为下一个循环提供模板DNA。单通道qPCR仪设置

qPCR实现了通过Ct值和标准曲线的分析对起始模板进行定量分析。上海灵敏度qPCR仪采购

q225 加样孔板侧壁和金属热块能够严密贴合,使液体样品迅速达到设定温度,从而减少实验时间。右上为 q225 在一次40 个循环的常规qPCR 实验内加热块温度变化情况,在整个实验过程中金属块升降温迅速且温度稳定,不受机器本身随实验时间延长而内部背景温度上升的影响。qPCR 反应所需时间很大程度上取决于对反应溶液进行变温所需要的时间,而这一过程又受到加热块升降温速度和液体升降温速度两方面的影响。q225 所使用的热循环系统峰值变温速率可达4°C/s,更重要的是,经过精密设计的加热块能够很大程度地贴合孔板形状,实现高效的热传导,使得在加热块达到预定温度后反应溶液也能在短时间内达到相同温度,反应溶液温度更为均一。q225 出色的热循环系统设计使得40 个循环的常规 qPCR 可以在短短43 分钟内轻松完成,让您的工作效率获得质的提升 。SNP基因分型SNP分型用HRM高分辨熔解曲线方法来做,速度快,效率高。在进行大量SNP标记分型时无需合成荧光探针和荧光引物。可以的节省实验成本。上海灵敏度qPCR仪采购

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